Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KitlgP20826 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KitlgP20826 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KitlgP20826 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KitlgP20826 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms