Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TP20293 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TP20293 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TP20293 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TP20293 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TP20293 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TP20293 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TP20293 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TP20293 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TP20293 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TP20293 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TP20293 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TP20293 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TP20293 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TP20293 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TP20293 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TP20293 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TP20293 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP20293 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP20293 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP20293 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP20293 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP20293 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TP20293 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP20293 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP20293 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP20293 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP20293 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP20293 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TP20293 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TP20293 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP20293 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP20293 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TP20293 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms