Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefhP19246 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefhP19246 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefhP19246 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefhP19246 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefhP19246 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefhP19246 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefhP19246 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefhP19246 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefhP19246 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefhP19246 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefhP19246 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefhP19246 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefhP19246 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefhP19246 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefhP19246 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefhP19246 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefhP19246 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefhP19246 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefhP19246 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefhP19246 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NefhP19246 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefhP19246 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefhP19246 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefhP19246 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefhP19246 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefhP19246 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefhP19246 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefhP19246 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefhP19246 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefhP19246 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefhP19246 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefhP19246 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefhP19246 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefhP19246 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefhP19246 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefhP19246 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefhP19246 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefhP19246 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefhP19246 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefhP19246 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefhP19246 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefhP19246 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NefhP19246 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefhP19246 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefhP19246 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefhP19246 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefhP19246 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NefhP19246 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NefhP19246 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefhP19246 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefhP19246 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefhP19246 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefhP19246 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefhP19246 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefhP19246 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefhP19246 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefhP19246 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefhP19246 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefhP19246 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NefhP19246 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefhP19246 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefhP19246 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefhP19246 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefhP19246 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefhP19246 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefhP19246 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms