Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18530 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18530 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18530 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18530 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18530 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18530 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18530 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18530 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18530 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P18530 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P18530 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18530 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18530 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms