Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SellP18337 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SellP18337 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SellP18337 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SellP18337 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SellP18337 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SellP18337 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SellP18337 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SellP18337 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SellP18337 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SellP18337 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SellP18337 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SellP18337 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms