Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs1P17533 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs1P17533 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs1P17533 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms