Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CnpP16330 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CnpP16330 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CnpP16330 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CnpP16330 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CnpP16330 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CnpP16330 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CnpP16330 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CnpP16330 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CnpP16330 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CnpP16330 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CnpP16330 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CnpP16330 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CnpP16330 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CnpP16330 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CnpP16330 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CnpP16330 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CnpP16330 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CnpP16330 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CnpP16330 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CnpP16330 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CnpP16330 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CnpP16330 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CnpP16330 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CnpP16330 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CnpP16330 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CnpP16330 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CnpP16330 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CnpP16330 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CnpP16330 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CnpP16330 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CnpP16330 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CnpP16330 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CnpP16330 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CnpP16330 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CnpP16330 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CnpP16330 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CnpP16330 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CnpP16330 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CnpP16330 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CnpP16330 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CnpP16330 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CnpP16330 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CnpP16330 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CnpP16330 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CnpP16330 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CnpP16330 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CnpP16330 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CnpP16330 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CnpP16330 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CnpP16330 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CnpP16330 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CnpP16330 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CnpP16330 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CnpP16330 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CnpP16330 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CnpP16330 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CnpP16330 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CnpP16330 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CnpP16330 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CnpP16330 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CnpP16330 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CnpP16330 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CnpP16330 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CnpP16330 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CnpP16330 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CnpP16330 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CnpP16330 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CnpP16330 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CnpP16330 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CnpP16330 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CnpP16330 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CnpP16330 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CnpP16330 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CnpP16330 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CnpP16330 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CnpP16330 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CnpP16330 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CnpP16330 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 348.7 ms