Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms