Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl1P12850 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms