Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp1P11983 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp1P11983 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp1P11983 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp1P11983 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp1P11983 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcp1P11983 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcp1P11983 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcp1P11983 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcp1P11983 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tcp1P11983 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcp1P11983 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcp1P11983 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcp1P11983 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcp1P11983 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tcp1P11983 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcp1P11983 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcp1P11983 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcp1P11983 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcp1P11983 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcp1P11983 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcp1P11983 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcp1P11983 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcp1P11983 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcp1P11983 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcp1P11983 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcp1P11983 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcp1P11983 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcp1P11983 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcp1P11983 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcp1P11983 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcp1P11983 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcp1P11983 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcp1P11983 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms