Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga5P11688 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga5P11688 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga5P11688 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms