Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Amd1P0DMN7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms