Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms