Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P0C1Z5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P0C1Z5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P0C1Z5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0C1Z5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C1Z5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C1Z5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C1Z5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C1Z5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C1Z5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C1Z5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C1Z5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C1Z5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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