Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb2P0C1T1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb2P0C1T1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms