Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa9P09631 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa9P09631 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms