Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms