Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna4P07351 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms