Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hoxa4P06798 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa4P06798 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms