Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06344 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06344 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P06344 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06344 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06344 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06344 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06344 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06344 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P06344 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06344 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06344 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06344 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06344 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P06344 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P06344 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06344 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06344 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06344 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06344 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06344 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06344 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06344 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06344 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms