Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04940 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04940 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04940 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04940 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P04940 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P04940 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04940 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04940 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04940 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04940 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04940 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04940 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04940 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04940 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04940 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04940 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04940 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04940 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04940 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms