Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Eb1P04230 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms