Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa7P02830 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms