Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53P02340 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53P02340 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53P02340 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53P02340 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53P02340 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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