Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-K1P01901 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-K1P01901 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms