Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01741 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01741 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01741 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01741 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01741 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01741 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01741 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01741 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01741 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01741 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01741 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01741 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01741 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01741 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01741 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01741 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01741 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01741 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01741 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01741 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01741 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01741 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01741 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms