Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01739 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01739 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01739 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01739 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01739 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01739 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01739 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01739 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01739 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01739 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01739 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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