Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01663 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01663 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01663 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01663 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01663 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01663 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01663 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01663 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01663 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01663 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01663 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01663 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01663 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01663 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms