Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01662 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01662 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01662 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01662 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01662 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01662 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01662 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01662 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01662 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01662 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01662 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01662 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01662 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms