Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01641 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01641 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01641 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01641 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01641 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01641 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01641 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01641 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01641 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01641 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01641 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01641 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01641 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01641 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01641 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01641 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01641 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01641 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01641 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01641 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01641 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01641 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01641 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01641 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P01641 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P01641 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01641 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01641 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01641 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01641 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01641 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P01641 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01641 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01641 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01641 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01641 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P01641 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01641 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01641 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01641 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01641 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01641 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01641 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01641 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01641 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01641 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01641 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01641 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms