Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifnb1P01575 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnb1P01575 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms