Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4bP01029 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4bP01029 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4bP01029 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4bP01029 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4bP01029 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4bP01029 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4bP01029 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4bP01029 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4bP01029 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4bP01029 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4bP01029 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4bP01029 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4bP01029 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4bP01029 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4bP01029 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C4bP01029 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4bP01029 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4bP01029 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4bP01029 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4bP01029 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C4bP01029 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4bP01029 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4bP01029 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4bP01029 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4bP01029 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4bP01029 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4bP01029 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4bP01029 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4bP01029 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4bP01029 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4bP01029 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4bP01029 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4bP01029 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4bP01029 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4bP01029 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4bP01029 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4bP01029 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4bP01029 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4bP01029 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4bP01029 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4bP01029 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4bP01029 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4bP01029 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4bP01029 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4bP01029 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4bP01029 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4bP01029 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4bP01029 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4bP01029 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4bP01029 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4bP01029 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4bP01029 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4bP01029 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4bP01029 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4bP01029 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4bP01029 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4bP01029 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4bP01029 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4bP01029 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4bP01029 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4bP01029 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4bP01029 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4bP01029 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4bP01029 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4bP01029 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C4bP01029 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4bP01029 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4bP01029 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4bP01029 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4bP01029 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4bP01029 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4bP01029 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4bP01029 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4bP01029 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms