Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl20O89093 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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