Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CpdO89001 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CpdO89001 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CpdO89001 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CpdO89001 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CpdO89001 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CpdO89001 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CpdO89001 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CpdO89001 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CpdO89001 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CpdO89001 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CpdO89001 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CpdO89001 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CpdO89001 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CpdO89001 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CpdO89001 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CpdO89001 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CpdO89001 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CpdO89001 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CpdO89001 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CpdO89001 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CpdO89001 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CpdO89001 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CpdO89001 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CpdO89001 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CpdO89001 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CpdO89001 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CpdO89001 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CpdO89001 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CpdO89001 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CpdO89001 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CpdO89001 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CpdO89001 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CpdO89001 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CpdO89001 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CpdO89001 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CpdO89001 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CpdO89001 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CpdO89001 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CpdO89001 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CpdO89001 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CpdO89001 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CpdO89001 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CpdO89001 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CpdO89001 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CpdO89001 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CpdO89001 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CpdO89001 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CpdO89001 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CpdO89001 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CpdO89001 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CpdO89001 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CpdO89001 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CpdO89001 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms