Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn3O88990 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn3O88990 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn3O88990 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn3O88990 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actn3O88990 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actn3O88990 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actn3O88990 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actn3O88990 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn3O88990 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn3O88990 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn3O88990 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn3O88990 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms