Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
F11rO88792 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F11rO88792 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F11rO88792 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F11rO88792 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
F11rO88792 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
F11rO88792 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
F11rO88792 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
F11rO88792 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F11rO88792 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F11rO88792 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
F11rO88792 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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