Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp23O88676 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Mmp23O88676 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Mmp23O88676 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp23O88676 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms