Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vti1bO88384 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vti1bO88384 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms