Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctnnal1O88327 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms