Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nid2O88322 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nid2O88322 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nid2O88322 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nid2O88322 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nid2O88322 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nid2O88322 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nid2O88322 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nid2O88322 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms