Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra6O70491 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra6O70491 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra6O70491 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra6O70491 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra6O70491 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stra6O70491 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra6O70491 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra6O70491 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra6O70491 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms