Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpl35aO55142 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpl35aO55142 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpl35aO55142 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rpl35aO55142 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rpl35aO55142 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpl35aO55142 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl35aO55142 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpl35aO55142 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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