Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrxO55103 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrxO55103 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrxO55103 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PrxO55103 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrxO55103 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrxO55103 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrxO55103 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrxO55103 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrxO55103 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PrxO55103 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PrxO55103 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PrxO55103 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PrxO55103 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PrxO55103 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PrxO55103 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PrxO55103 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PrxO55103 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PrxO55103 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PrxO55103 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PrxO55103 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrxO55103 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrxO55103 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrxO55103 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrxO55103 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrxO55103 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrxO55103 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrxO55103 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrxO55103 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrxO55103 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrxO55103 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrxO55103 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrxO55103 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrxO55103 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrxO55103 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrxO55103 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrxO55103 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrxO55103 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrxO55103 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrxO55103 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrxO55103 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrxO55103 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrxO55103 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrxO55103 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrxO55103 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrxO55103 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PrxO55103 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrxO55103 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrxO55103 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrxO55103 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrxO55103 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrxO55103 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrxO55103 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrxO55103 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrxO55103 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrxO55103 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PrxO55103 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PrxO55103 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PrxO55103 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrxO55103 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrxO55103 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrxO55103 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrxO55103 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrxO55103 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrxO55103 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrxO55103 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PrxO55103 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrxO55103 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms