Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trdmt1O55055 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trdmt1O55055 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms