Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CaluO35887 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CaluO35887 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CaluO35887 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CaluO35887 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaluO35887 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaluO35887 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaluO35887 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaluO35887 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaluO35887 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaluO35887 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaluO35887 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaluO35887 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CaluO35887 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CaluO35887 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CaluO35887 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CaluO35887 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CaluO35887 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CaluO35887 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CaluO35887 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaluO35887 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CaluO35887 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CaluO35887 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CaluO35887 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CaluO35887 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CaluO35887 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CaluO35887 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CaluO35887 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CaluO35887 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaluO35887 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CaluO35887 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CaluO35887 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CaluO35887 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CaluO35887 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CaluO35887 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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