Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms