Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc27a2O35488 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc27a2O35488 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms