Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sprr3O09116 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sprr3O09116 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sprr3O09116 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr3O09116 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms