Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcshO08795 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms