Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna5O08543 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Efna5O08543 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna5O08543 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms